Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BEX3Q00994 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms