Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK6Q00534 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CDK6Q00534 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms