Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ACTG1P63261 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms