Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ARF6P62330 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ARF6P62330 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ARF6P62330 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARF6P62330 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ARF6P62330 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ARF6P62330 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms