Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNRPD1P62314 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNRPD1P62314 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms