Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SNRPEP62304 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNRPEP62304 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms