Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ERVFC1P60507 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ERVFC1P60507 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms