Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
UBASH3AP57075 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBASH3AP57075 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms