Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KCNQ4P56696 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KCNQ4P56696 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KCNQ4P56696 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms