Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARL4CP56559 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARL4CP56559 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms