Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
GFRA1P56159 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GFRA1P56159 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms