Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP7P55210 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP7P55210 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CASP7P55210 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CASP7P55210 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CASP7P55210 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CASP7P55210 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP7P55210 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP7P55210 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP7P55210 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP7P55210 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CASP7P55210 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CASP7P55210 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP7P55210 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CASP7P55210 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CASP7P55210 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CASP7P55210 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CASP7P55210 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CASP7P55210 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms