Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ELLP55199 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ELLP55199 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ELLP55199 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ELLP55199 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ELLP55199 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ELLP55199 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ELLP55199 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms