Protein–RNA interactions for Protein: P55060

CSE1L, Exportin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSE1LP55060 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSE1LP55060 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSE1LP55060 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms