Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NRLP54845 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NRLP54845 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NRLP54845 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRLP54845 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NRLP54845 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NRLP54845 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NRLP54845 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NRLP54845 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NRLP54845 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NRLP54845 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms