Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATXN3P54252 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATXN3P54252 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms