Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNP53814 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNP53814 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SMTNP53814 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SMTNP53814 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SMTNP53814 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SMTNP53814 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SMTNP53814 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMTNP53814 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms