Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
UBE2E1P51965 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
UBE2E1P51965 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms