Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCNN1GP51170 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SCNN1GP51170 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCNN1GP51170 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms