Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSNK1EP49674 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSNK1EP49674 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms