Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NPTX2P47972 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NPTX2P47972 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms