Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CRATP43155 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CRATP43155 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CRATP43155 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CRATP43155 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CRATP43155 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CRATP43155 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CRATP43155 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CRATP43155 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms