Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PNPLA4P41247 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNPLA4P41247 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNPLA4P41247 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms