Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RFC5P40937 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RFC5P40937 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RFC5P40937 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RFC5P40937 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RFC5P40937 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RFC5P40937 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RFC5P40937 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RFC5P40937 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms