Protein–RNA interactions for Protein: P40424

PBX1, Pre-B-cell leukemia transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1P40424 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PBX1P40424 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX1P40424 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX1P40424 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX1P40424 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX1P40424 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX1P40424 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PBX1P40424 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PBX1P40424 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PBX1P40424 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PBX1P40424 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PBX1P40424 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PBX1P40424 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PBX1P40424 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms