Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SREBF1P36956 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SREBF1P36956 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms