Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFC4P35249 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFC4P35249 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFC4P35249 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFC4P35249 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFC4P35249 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC4P35249 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC4P35249 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC4P35249 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC4P35249 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC4P35249 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFC4P35249 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC4P35249 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC4P35249 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC4P35249 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC4P35249 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFC4P35249 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFC4P35249 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RFC4P35249 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFC4P35249 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFC4P35249 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFC4P35249 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFC4P35249 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFC4P35249 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RFC4P35249 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFC4P35249 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms