Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NTF4P34130 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF4P34130 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF4P34130 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF4P34130 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF4P34130 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF4P34130 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms