Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCKARP32238 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCKARP32238 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKARP32238 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCKARP32238 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCKARP32238 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCKARP32238 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCKARP32238 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCKARP32238 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCKARP32238 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms