Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HOXC8P31273 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXC8P31273 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms