Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
HLA-FP30511 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HLA-FP30511 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-FP30511 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms