Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TM4SF1P30408 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TM4SF1P30408 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TM4SF1P30408 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms