Protein–RNA interactions for Protein: P30281

CCND3, G1/S-specific cyclin-D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND3P30281 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCND3P30281 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCND3P30281 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCND3P30281 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCND3P30281 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCND3P30281 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCND3P30281 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCND3P30281 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCND3P30281 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms