Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB2P29033 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB2P29033 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB2P29033 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB2P29033 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB2P29033 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
GJB2P29033 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB2P29033 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GJB2P29033 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB2P29033 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB2P29033 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB2P29033 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB2P29033 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB2P29033 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GJB2P29033 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GJB2P29033 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJB2P29033 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms