Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SSFA2P28290 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SSFA2P28290 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SSFA2P28290 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms