Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MARK3P27448 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MARK3P27448 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MARK3P27448 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MARK3P27448 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MARK3P27448 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MARK3P27448 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MARK3P27448 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MARK3P27448 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms