Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TCEA1P23193 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TCEA1P23193 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms