Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRHP20396 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRHP20396 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
TRHP20396 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRHP20396 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
TRHP20396 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TRHP20396 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRHP20396 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TRHP20396 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TRHP20396 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRHP20396 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TRHP20396 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRHP20396 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRHP20396 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TRHP20396 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TRHP20396 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRHP20396 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRHP20396 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRHP20396 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TRHP20396 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms