Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SPI1P17947 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SPI1P17947 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SPI1P17947 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SPI1P17947 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SPI1P17947 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPI1P17947 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPI1P17947 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPI1P17947 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms