Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ITGB4P16144 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGB4P16144 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms