Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TCF4P15884 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TCF4P15884 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF4P15884 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF4P15884 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF4P15884 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF4P15884 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF4P15884 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF4P15884 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF4P15884 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF4P15884 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF4P15884 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms