Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VEGFAP15692 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VEGFAP15692 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VEGFAP15692 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms