Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNRPBP14678 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNRPBP14678 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms