Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ETFAP13804 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ETFAP13804 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ETFAP13804 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ETFAP13804 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ETFAP13804 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETFAP13804 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETFAP13804 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETFAP13804 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETFAP13804 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ETFAP13804 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ETFAP13804 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms