Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ODC1P11926 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ODC1P11926 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ODC1P11926 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ODC1P11926 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODC1P11926 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ODC1P11926 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODC1P11926 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODC1P11926 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODC1P11926 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ODC1P11926 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ODC1P11926 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ODC1P11926 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ODC1P11926 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ODC1P11926 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ODC1P11926 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ODC1P11926 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ODC1P11926 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms