Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TOP1P11387 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TOP1P11387 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TOP1P11387 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TOP1P11387 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
TOP1P11387 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TOP1P11387 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TOP1P11387 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1P11387 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1P11387 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1P11387 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1P11387 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TOP1P11387 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TOP1P11387 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms