Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ITGAMP11215 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ITGAMP11215 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms