Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARAP10276 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RARAP10276 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARAP10276 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARAP10276 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARAP10276 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARAP10276 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARAP10276 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARAP10276 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARAP10276 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RARAP10276 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARAP10276 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARAP10276 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RARAP10276 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RARAP10276 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RARAP10276 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RARAP10276 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RARAP10276 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RARAP10276 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RARAP10276 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms