Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APELAP0DMC3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APELAP0DMC3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
APELAP0DMC3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
APELAP0DMC3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
APELAP0DMC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
APELAP0DMC3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms