Protein–RNA interactions for Protein: P0DL12

SMIM17, Small integral membrane protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM17P0DL12 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM17P0DL12 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM17P0DL12 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms